Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP49Q70CQ1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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