Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NRF1Q16656 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NRF1Q16656 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.2 ms