Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDB1Q16531 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDB1Q16531 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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