Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
DDX39BQ13838 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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