Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRAP18433 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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PTPRAP18433 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRAP18433 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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