Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP49Q70CQ1 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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USP49Q70CQ1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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USP49Q70CQ1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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USP49Q70CQ1 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
USP49Q70CQ1 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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