Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LINC00336Q6ZUF6 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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LINC00336Q6ZUF6 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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LINC00336Q6ZUF6 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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LINC00336Q6ZUF6 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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LINC00336Q6ZUF6 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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