Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTF1Q15361 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTF1Q15361 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.1 ms