Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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COL9A2Q14055 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COL9A2Q14055 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
COL9A2Q14055 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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