Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
DDX39BQ13838 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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