Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RIPK1Q13546 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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