Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNN3Q15417 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNN3Q15417 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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