Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NCF4Q15080 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NCF4Q15080 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.5 ms