Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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SNX17Q15036 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX17Q15036 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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