Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIPK1Q13546 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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