Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PDE3BQ13370 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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