Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PnckQ9QYK9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PnckQ9QYK9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms