Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gps1Q99LD4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms