Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssxb10Q6XAR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ssxb10Q6XAR7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb10Q6XAR7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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