Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Psme1P97371 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms