Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm2aP59997 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm2aP59997 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms