Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnga1P29974 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms