Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhoP15409 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhoP15409 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms