Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms