Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms