Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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GRIK3Q13003 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
GRIK3Q13003 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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