Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SNX13Q9Y5W8 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.3 ms