Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZIC1Q15915 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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