Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TTF1Q15361 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TTF1Q15361 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TTF1Q15361 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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