Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNTA1Q13424 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNTA1Q13424 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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