Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPN13Q12923 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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