Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SEC23BQ15437 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SEC23BQ15437 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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SEC23BQ15437 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SEC23BQ15437 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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SEC23BQ15437 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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