Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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