Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHOC2Q9UQ13 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SHOC2Q9UQ13 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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