Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
RDH8Q9NYR8 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RDH8Q9NYR8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RDH8Q9NYR8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RDH8Q9NYR8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.6 ms