Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZIC1Q15915 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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