Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
DDX39BQ13838 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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