Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CCDC74AQ96AQ1 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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