Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDX39BQ13838 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDX39BQ13838 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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