Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDB1Q16531 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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