Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Edf1Q9JMG1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms