Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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