Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 669.3 ms