Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms