Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhoP15409 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhoP15409 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhoP15409 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhoP15409 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms