Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01666 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01666 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01666 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01666 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01666 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01666 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms