Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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FOXD4Q12950 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXD4Q12950 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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