Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KLF9Q13886 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms