Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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COL9A2Q14055 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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