Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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